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眼科系由我国著名眼科教育家、一流教授郭秉宽创建于1952年。自成立以来,眼科医疗和科研水平一直处于全国前列,是全国三大传统眼科中心之一。眼科是教育部重点学科、国家临床重点专科、卫生部重点学科。是教育部首批硕士、博士研究生培养基地和博士后流动站之一。目前,眼科已发展成为集医疗、教学、科研、防盲治盲为一体的重要机构。眼科拥有卫生部近视重点实验室、上海市视力障碍与重建重点实验室、上海市眼科临床质量控制中心。是卫生部眼科和上海市住院医师规范化培训基地,也是上海市红十字眼科诊所。图书馆常设机构。
眼科共有在职博士175人,其中正高级职称26人,副高级职称35人,博士研究生16人,硕士研究生25人。人才队伍日趋年轻化,50岁以下的眼科医生占92%,研究生以上学历占眼科医生的99.2%。拥有专职研究人员27人,高级职称比例为22.2%。眼科组建了一支由优秀临床专家和高端科研人才领衔的学术专家团队,其中当选中华医学会眼科学会主任委员1名、上海市领军人才4名。承担国家自然科学基金、国家JIA863项目、卫生部、上海市等各级科研项目数十项,获得国家科技成果二等奖等十余项奖励。贾氏科学技术进步奖、中华医学科技奖、上海市科学技术进步奖、上海市医学科学技术奖。
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